MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halogeometricum borinquense DSM 11551 chromosome

Total Repeats: 70333

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014729	AC	3	6	48	53	50 %	0 %	0 %	50 %	313124789
2	NC_014729	CGAC	2	8	92	99	25 %	0 %	25 %	50 %	313124789
3	NC_014729	GCC	2	6	143	148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313124789
4	NC_014729	CGG	2	6	163	168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313124789
5	NC_014729	CTT	2	6	239	244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313124789
6	NC_014729	CCGG	2	8	298	305	0 %	0 %	50 %	50 %	313124789
7	NC_014729	CGG	2	6	352	357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313124789
8	NC_014729	CAG	2	6	429	434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313124789
9	NC_014729	CGC	2	6	441	446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313124789
10	NC_014729	CAC	2	6	467	472	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313124789
11	NC_014729	TCA	2	6	481	486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313124789
12	NC_014729	CGA	2	6	499	504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313124789
13	NC_014729	TCGC	2	8	521	528	0 %	25 %	25 %	50 %	313124789
14	NC_014729	CGAC	2	8	559	566	25 %	0 %	25 %	50 %	313124789
15	NC_014729	ACG	2	6	616	621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313124789
16	NC_014729	CAT	2	6	635	640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313124789
17	NC_014729	CGC	2	6	680	685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313124789
18	NC_014729	ACG	2	6	760	765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313124789
19	NC_014729	GA	3	6	802	807	50 %	0 %	50 %	0 %	313124789
20	NC_014729	ACG	2	6	831	836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313124789
21	NC_014729	GAC	2	6	843	848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313124789
22	NC_014729	ACG	2	6	856	861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313124789
23	NC_014729	CCT	2	6	881	886	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313124789
24	NC_014729	GAC	2	6	987	992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313124789
25	NC_014729	GGC	2	6	1025	1030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313124789
26	NC_014729	GAG	2	6	1050	1055	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313124789
27	NC_014729	GCC	2	6	1118	1123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313124790
28	NC_014729	TTC	2	6	1190	1195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313124790
29	NC_014729	CAT	2	6	1228	1233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313124790
30	NC_014729	CGCC	2	8	1236	1243	0 %	0 %	25 %	75 %	313124790
31	NC_014729	GAG	2	6	1268	1273	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313124790
32	NC_014729	CG	3	6	1328	1333	0 %	0 %	50 %	50 %	313124790
33	NC_014729	CGACG	2	10	1339	1348	20 %	0 %	40 %	40 %	313124790
34	NC_014729	CACC	2	8	1360	1367	25 %	0 %	0 %	75 %	313124790
35	NC_014729	GAACG	2	10	1406	1415	40 %	0 %	40 %	20 %	313124790
36	NC_014729	TCG	2	6	1486	1491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124790
37	NC_014729	ACG	2	6	1515	1520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313124790
38	NC_014729	CTCG	2	8	1523	1530	0 %	25 %	25 %	50 %	313124790
39	NC_014729	CTC	2	6	1577	1582	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313124790
40	NC_014729	CCG	2	6	1583	1588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313124790
41	NC_014729	CCT	2	6	1606	1611	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313124790
42	NC_014729	AGTC	2	8	1644	1651	25 %	25 %	25 %	25 %	313124790
43	NC_014729	CG	3	6	1654	1659	0 %	0 %	50 %	50 %	313124790
44	NC_014729	ACA	2	6	1676	1681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_014729	TCC	2	6	1732	1737	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313124791
46	NC_014729	GAA	2	6	1738	1743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313124791
47	NC_014729	TCG	2	6	1793	1798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124791
48	NC_014729	TCC	2	6	1799	1804	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313124791
49	NC_014729	GCG	2	6	1814	1819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313124791
50	NC_014729	CGC	2	6	1872	1877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313124791
51	NC_014729	GGT	2	6	1885	1890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313124791
52	NC_014729	GCG	2	6	1891	1896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313124791
53	NC_014729	TCG	2	6	1901	1906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124791
54	NC_014729	CTG	2	6	1918	1923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124791
55	NC_014729	GGTTCT	2	12	1937	1948	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	313124791
56	NC_014729	CCG	2	6	1992	1997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_014729	TGG	2	6	2084	2089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313124792
58	NC_014729	CGT	2	6	2095	2100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124792
59	NC_014729	TCG	2	6	2112	2117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124792
60	NC_014729	CTG	2	6	2129	2134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124792
61	NC_014729	TCA	2	6	2157	2162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313124792
62	NC_014729	CGC	2	6	2200	2205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313124792
63	NC_014729	GTTC	2	8	2263	2270	0 %	50 %	25 %	25 %	313124792
64	NC_014729	GTCT	2	8	2273	2280	0 %	50 %	25 %	25 %	313124792
65	NC_014729	CGA	2	6	2303	2308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313124792
66	NC_014729	CGT	2	6	2350	2355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124792
67	NC_014729	TCG	2	6	2361	2366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124792
68	NC_014729	CAC	2	6	2377	2382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313124792
69	NC_014729	TCG	2	6	2388	2393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124792
70	NC_014729	CGC	3	9	2426	2434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313124792
71	NC_014729	GA	3	6	2471	2476	50 %	0 %	50 %	0 %	313124793
72	NC_014729	AGCG	2	8	2495	2502	25 %	0 %	50 %	25 %	313124793
73	NC_014729	CG	3	6	2522	2527	0 %	0 %	50 %	50 %	313124793
74	NC_014729	GCC	2	6	2606	2611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313124793
75	NC_014729	GGCG	2	8	2649	2656	0 %	0 %	75 %	25 %	313124793
76	NC_014729	ACT	2	6	2690	2695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313124793
77	NC_014729	CGT	2	6	2706	2711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124793
78	NC_014729	CAC	2	6	2736	2741	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313124793
79	NC_014729	GAC	2	6	2743	2748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313124793
80	NC_014729	CGC	2	6	2829	2834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313124793
81	NC_014729	CGA	2	6	2841	2846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313124793
82	NC_014729	GCC	2	6	2866	2871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313124793
83	NC_014729	CGC	2	6	2920	2925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313124793
84	NC_014729	CG	3	6	2938	2943	0 %	0 %	50 %	50 %	313124793
85	NC_014729	GAA	2	6	2974	2979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313124793
86	NC_014729	CGGT	2	8	2984	2991	0 %	25 %	50 %	25 %	313124793
87	NC_014729	GGC	2	6	3022	3027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313124793
88	NC_014729	TCG	2	6	3053	3058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124793
89	NC_014729	GGA	2	6	3072	3077	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313124793
90	NC_014729	GTC	2	6	3088	3093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124793
91	NC_014729	CGC	2	6	3126	3131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313124793
92	NC_014729	GC	3	6	3135	3140	0 %	0 %	50 %	50 %	313124793
93	NC_014729	CGG	2	6	3144	3149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313124793
94	NC_014729	GAA	3	9	3167	3175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313124793
95	NC_014729	CGAA	2	8	3216	3223	50 %	0 %	25 %	25 %	313124793
96	NC_014729	GACG	2	8	3324	3331	25 %	0 %	50 %	25 %	313124793
97	NC_014729	GGC	3	9	3376	3384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313124793
98	NC_014729	GCG	2	6	3401	3406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313124793
99	NC_014729	CCT	2	6	3420	3425	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313124793
100	NC_014729	CG	3	6	3469	3474	0 %	0 %	50 %	50 %	313124793
101	NC_014729	CCGA	2	8	3552	3559	25 %	0 %	25 %	50 %	313124793
102	NC_014729	GAT	2	6	3590	3595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313124794
103	NC_014729	TCT	2	6	3673	3678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313124794
104	NC_014729	ACC	2	6	3699	3704	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313124794
105	NC_014729	GC	3	6	3729	3734	0 %	0 %	50 %	50 %	313124794
106	NC_014729	TTCG	2	8	3747	3754	0 %	50 %	25 %	25 %	313124794
107	NC_014729	CCG	2	6	3780	3785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313124794
108	NC_014729	CGC	3	9	3797	3805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313124794
109	NC_014729	CTT	2	6	3824	3829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313124794
110	NC_014729	CGT	2	6	3830	3835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124794
111	NC_014729	TCA	2	6	3855	3860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313124794
112	NC_014729	CGT	2	6	3884	3889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124794
113	NC_014729	CGC	2	6	3890	3895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313124794
114	NC_014729	GTC	2	6	4000	4005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_014729	GACC	2	8	4010	4017	25 %	0 %	25 %	50 %	313124795
116	NC_014729	GTC	2	6	4044	4049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124795
117	NC_014729	GCG	2	6	4170	4175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313124795
118	NC_014729	GACG	2	8	4220	4227	25 %	0 %	50 %	25 %	313124795
119	NC_014729	GAACCT	2	12	4343	4354	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	313124795
120	NC_014729	GTC	2	6	4446	4451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124795
121	NC_014729	TCGGG	2	10	4462	4471	0 %	20 %	60 %	20 %	313124795
122	NC_014729	TCA	2	6	4480	4485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313124795
123	NC_014729	TC	3	6	4534	4539	0 %	50 %	0 %	50 %	313124795
124	NC_014729	CGG	2	6	4562	4567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313124795
125	NC_014729	CTTT	2	8	4579	4586	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_014729	GACG	2	8	4588	4595	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
127	NC_014729	GTC	2	6	4611	4616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_014729	TC	3	6	4722	4727	0 %	50 %	0 %	50 %	313124796
129	NC_014729	CGC	2	6	4743	4748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313124796
130	NC_014729	TCG	3	9	4787	4795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124796
131	NC_014729	CGG	2	6	4805	4810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313124796
132	NC_014729	CGT	3	9	4818	4826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124796
133	NC_014729	CAC	2	6	4827	4832	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313124796
134	NC_014729	AACTC	2	10	4838	4847	40 %	20 %	0 %	40 %	313124796
135	NC_014729	TCG	2	6	4862	4867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124796
136	NC_014729	CAT	2	6	4869	4874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313124796
137	NC_014729	CT	3	6	4994	4999	0 %	50 %	0 %	50 %	313124796
138	NC_014729	GCG	2	6	5113	5118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313124797
139	NC_014729	CCGC	2	8	5120	5127	0 %	0 %	25 %	75 %	313124797
140	NC_014729	AGT	2	6	5149	5154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313124797
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142	NC_014729	GTTT	2	8	5196	5203	0 %	75 %	25 %	0 %	313124797
143	NC_014729	CAC	2	6	5206	5211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313124797
144	NC_014729	CCT	2	6	5229	5234	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313124797
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154	NC_014729	CCT	2	6	5545	5550	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313124797
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239	NC_014729	AGCGA	2	10	9047	9056	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
240	NC_014729	CGA	2	6	9095	9100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
241	NC_014729	CGA	2	6	9185	9190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313124801
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245	NC_014729	CTG	2	6	9357	9362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124801
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253	NC_014729	TCG	2	6	9604	9609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124801
254	NC_014729	GCG	2	6	9610	9615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313124801
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256	NC_014729	GAC	3	9	9623	9631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313124801
257	NC_014729	CG	3	6	9648	9653	0 %	0 %	50 %	50 %	313124801
258	NC_014729	GAC	3	9	9657	9665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313124801
259	NC_014729	ACA	2	6	9724	9729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313124801
260	NC_014729	CACGG	2	10	9732	9741	20 %	0 %	40 %	40 %	313124801
261	NC_014729	GAC	2	6	9770	9775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313124801
262	NC_014729	GAA	2	6	9794	9799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313124801
263	NC_014729	CGT	3	9	9800	9808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124801
264	NC_014729	GGCTAC	2	12	9813	9824	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	313124801
265	NC_014729	GGC	2	6	9848	9853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313124801
266	NC_014729	TCG	2	6	9874	9879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124801
267	NC_014729	CGC	2	6	9894	9899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313124801
268	NC_014729	GC	3	6	9898	9903	0 %	0 %	50 %	50 %	313124801
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293	NC_014729	CTGT	2	8	10728	10735	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
294	NC_014729	CG	3	6	10746	10751	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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487	NC_014729	GCGCG	2	10	18119	18128	0 %	0 %	60 %	40 %	313124814
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